利益相关:办公室地点:中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所达尔文馆209,进化基因组学实验室 口头禅:不着急,so far so good,有劳,谢谢,不着急 导师能力:导师能力高,以下内容摘自进化所官网: 主要学术成就: 基于全基因组和转录组测序的变异积累实验,揭示了多种模式生物基因组自发变异的规律和进化机制,阐明了细菌在环境胁迫下的变异率进化规律与变异形成机制,以及设计了新的实验系统,测算了自发变异造成的适应度效应。在PNAS, Nature Ecology and Evolution, Molecular Biology and Evolution, Genetics等主流进化生物学杂志上发表文章20余篇。 研究方向: 以微生物为主要研究对象,聚焦微生物的基因组演化以及生殖方式的功能基因组学研究,具体研究方向如下: A. 以海洋纤毛虫拟瞬膜虫为实验材料,通过高通量测序方法以及细胞生物学手段,研究纤毛虫原生动物生殖方式的功能基因组学 B. 深海微生物的基因组进化以及稳定性机制 C. 微生物环境胁迫下的变异形成 D. 医疗及环境水体中病源微生物的抗药性演化 E. 病害纤毛虫的生物学防治 F. 海洋纤毛虫的宏基因组学 Honors and Awards: 2017 Young Investigator Travel Award, Society for Molecular Biology and Evolution; 2016 Delill Nasser Award for Professional Development in Genetics, Genetics Society of America; 2012 Friends of NSM Fellowship, University of Houston. Research Interests: microbial evolutionary genomics, functional genomics of microbial reproduction, check more details in lab webpage: http://longhongan.weebly.com/ 经费发放:经费充足,支持学生去各地参加会议以及采样 学生
利益相关:龙红岸 教授,博士生导师,以微生物为主要研究对象,利用组学、分子遗传学和细胞生物学方法,结合种群遗传学与微生物学理论,聚焦微生物的基因组突变以及行为的进化生物学研究。办公地点位于中国海洋大学达尔文馆201 导师能力:近期代表性论文: Long*, H.; Miller, S.F.; Williams, E.; Lynch, M. 2018. Specificity of the DNA mismatch repair system (MMR) and mutagenesis bias in bacteria. Molecular Biology and Evolution. In press. Long#, H.; Sung#, W.; Kucukyildirim#,S.; Williams,E.; Miller, S.;Guo, W.; Patterson, C.; Gregory, C.; Strauss, C.; Stone, C.; Berne, C.; Kysela, D.; Shoemaker, W.; Muscarella, M.; Luo, H.; Lennon, J.; Brun, Y.; Lynch*, M. 2018. Evolutionary determinants of genome-wide nucleotide composition. Nature Ecology and Evolution. 2: 237-240. Strauss, C.; Long*, H.; Patterson, C.; Te,R.; Lynch, M. 2017. Genome-wide mutation rate response to pH change in the coral reef pathogen Vibrio shilonii AK1. mBio.8 (4): e01021-17 Long, H.; Miller, Samuel F; Strauss, Chloe; Zhao, Chaoxian; Cheng, Lei; Ye, Zhiqiang; Griffin, Katherine; Te, Ronald; Lee, Heewook; Chen, Chi-Chun; Lynch*, Michael. 2016. Antibiotic treatment enhances the genome-wide mutation rate of target cells. Proceedings of the National Academy of Sciences U.S.A. 113(18): E2498-E2505 (本研究由首作者独立设计) Long*,#, H.; Kucukyildirim#, Sibel; Sung, Way; Williams, Emily; Lee, Heewook; Ackerman, Matthew; Doak, Thomas G; Tang, Haixu; Lynch, Michael. 2015. Background mutational features of the radiation-resistant bacterium Deinococcus radiodurans. Molecular Biology and Evolution 32(9): 2383-2392 Long*, H.; Sung, Way; Miller, Samuel F; Ackerman, Matthew S; Doak, Thomas G; Lynch, Michael. 2015. Mutation rate, spectrum, topology, and context-dependency in the DNA mismatch repair-deficient Pseudomonas fluorescensATCC948. Genome Biology and Evolution 7(1): 262-271 Farlow#,*, Ashley; Long#, H.; Arnoux, Stéphanie; Sung, Way; Doak, Thomas G; Nordborg, Magnus; Lynch, Michael. 2015. The spontaneous mutation rate in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. Genetics 201(2):737-744 Long*, H.; Paixão, Tiago; Azevedo, Ricardo BR; Zufall, Rebecca A. 2013. Accumulation of spontaneous mutations in the ciliate Tetrahymena thermophila. Genetics 195(2): 527-540 Long*, H.; Zufall, R.A. 2010. Diverse modes of reproduction in the marine free-living ciliate Glauconema trihymene. BMC Microbiology 10(1): 108 经费发放:国家自然科学基金面上项目(31872228; 2019.1-2022.12) 中国海洋大学“筑峰人才计划”启动经费(2018.9-2021.8) 中央高校基本科研业务费(2018.1-2021.1) 学生补助:每个月800元 与学生关系:初识红岸,是在一来一往邮件中,其风趣话语引人好奇。初见红岸,其直率严谨名副其实,以平等合作之名要求直呼其名,幽默又不缺谆谆诱导。 工作时间:工作时间一般学生自行安排,导师不强制安排。 学生毕业去向:红岸尊重每一个学生的选择,无论是工作,读博还是出国,他都会尽力帮助每个人学生,并且我也相信他有这个能力!
利益相关:办公室地点:中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所达尔文馆209,进化基因组学实验室 口头禅:不着急,so far so good,有劳,谢谢,不着急 导师能力:导师能力高,以下内容摘自进化所官网: 主要学术成就: 基于全基因组和转录组测序的变异积累实验,揭示了多种模式生物基因组自发变异的规律和进化机制,阐明了细菌在环境胁迫下的变异率进化规律与变异形成机制,以及设计了新的实验系统,测算了自发变异造成的适应度效应。在PNAS, Nature Ecology and Evolution, Molecular Biology and Evolution, Genetics等主流进化生物学杂志上发表文章20余篇。 研究方向: 以微生物为主要研究对象,聚焦微生物的基因组演化以及生殖方式的功能基因组学研究,具体研究方向如下: A. 以海洋纤毛虫拟瞬膜虫为实验材料,通过高通量测序方法以及细胞生物学手段,研究纤毛虫原生动物生殖方式的功能基因组学 B. 深海微生物的基因组进化以及稳定性机制 C. 微生物环境胁迫下的变异形成 D. 医疗及环境水体中病源微生物的抗药性演化 E. 病害纤毛虫的生物学防治 F. 海洋纤毛虫的宏基因组学 Honors and Awards: 2017 Young Investigator Travel Award, Society for Molecular Biology and Evolution; 2016 Delill Nasser Award for Professional Development in Genetics, Genetics Society of America; 2012 Friends of NSM Fellowship, University of Houston. Research Interests: microbial evolutionary genomics, functional genomics of microbial reproduction, check more details in lab webpage: http://longhongan.weebly.com/ 经费发放:经费充足,支持学生去各地参加会议以及采样 学生补助:研究生每月1000及以上,本科生每月500及以上 与学生关系:与学生关系很平等,他为了锻炼学生的胆量以及强调师生之间的平等关系,让我们无论在何种场合下都直呼他的名字--红岸。他希望研究生把更多的时间花在学习、思考以及阅读文献上,所以基本不安排杂活,而且为了减轻研究生在实验过程中的重复性操作,还聘请了很多本科生助理来分担重复性的实验操作。 工作时间:红岸有两个孩子,周六是他固定带孩子的日子,其余时间都在实验室或者办公室,而且通常待到很晚才回去,偶尔周六也会来实验室。 研究生没有固定的作息和工作时间要求,只要知道自己做什么,能够完成就行。 学生毕业去向:红岸是2017年回国并开始组建实验室,目前的学生都是研二,还没有具体的出路。但他的包容性很强,因材施教,对于想出国,或想继续科研,或想工作的学生都有不同的培养方案。